Plus de fichiers cachés

Bonjour,

Suite à une infection (je n'ai pas retenu le nom sur le coup, mais fil en aiguille je pense pouvoir dire qu'il s'agit d'un Bagle), je ne peux plus afficher mes fichiers cachés.
J'ai trouvé une ligne de registre qui permet de remettre l'option dans Outils, Options des dossiers... (oui le choix "voulez vous afficher les dossiers et fichiers cachés" n'était même plus disponible), mais je n'ai toujours pas mon affichage.
Pourtant ils sont là, d'une part car sinon je ne booterai pas... (boot.ini) et d'autre part car je les vois avec l'explorateur de Filezilla par exemple.

J'ai essayé beacoup de choses : utilitaires de désinfections spécifiques au bagle (a priori je ne suis plus infecté),
Spybot, CCleaner, Hijackthis (je ne suis pas un pro mais je n'ai pas trouvé de ligne qui pourrait être corrigée... peut-être puis-je posté le log ?)

merci à celui qui pourra m'éclairer.